在 PubMed 中，有时用户希望将查找范围，限缩在某些特定主题的文献，譬如医师希望优先阅读临床的诊断、治疗、预防方面的文献，或证据等级较高的系统性评论文献；又或者兽医师希望将查找范围限缩在兽医主题的文献…。这样的需求，因为不是单纯的具体目标查找，而是较具规模、系统性地筛选出一个主题范围的文献，很难通过几个简单的关键字、或选定几个 MeSH Terms 就捞出这样范围的文献群，而是需要兼具领域知识的了解、文献词汇的掌握度、以及缜密的逻辑结合，才能下达正确有效的检索指令，捞出这种主题范围性的文献群。
针对这些需求，PubMed 很贴心地设计了“Clinical Queries”与“Topic-Specific Queries”。这是针对特定的主题需求，预先设计好的一串完整检索指令，用户可以套用这些现成指令，在PubMed中直接筛选出条件相符的文献。例如，以下这是 PubMed 设计好用来检索“Therapy临床治疗”主题文献的指令：
((clinical[Title/Abstract] AND trial[Title/Abstract]) OR clinical trials as topic[MeSH Terms] OR clinical trial[Publication Type] OR random*[Title/Abstract] OR random allocation[MeSH Terms] OR therapeutic use[MeSH Subheading])
这么长一串要正确无误地打出其实并不容易，而现在您可以直接套用，若再加上其他关键词，例如：“Ritalin”、“ADHD”，就可以查找“以 Ritalin 治疗 ADHD 在临床方面”的文献了。像这样现成的主题筛选检索指令，都罗列在PubMed 的“Clinical Queries”与“Topic-Specific Queries”中，可多加利用！
“Clinical Queries”在 PubMed 主页的“Find”区块：
先介绍“Clinical Queries”，分为三大主题类别(filter category)，第一个为“COVID-19”，因应2019年起的新冠肺炎全球流行疫情，以协助快速、即时找出大量的相关临床文献，另外两个主题类别为“Clinical Study Categories”以及“Medical Genetics”，每个类别下有各自已设置好的筛选主题(filter)。分别介绍如下：
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- Search for COVID-19 article：目前的筛选主题[filter]包含：General(通则)、Mechanism(机理)、Transmission(传播)、Diagnosis(诊断)、Treatment(治疗)、Prevention(预防)、Case Report(病例研究)、Forecasting(预测)、Long COVID(长新冠)。其筛选主题[filter]详细指令请见：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/help/
- Search for clinical study category：筛选主题[filter]有：Therapy(治疗)、Diagnosis(诊断)、Etiology(病因)、Prognosis(预后)、Clinical Prediction Guides(临床预测指南)。其筛选主题[filter]详细令请见：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/help/
- Medical genetics searches：医学遗传学，其筛选主题包含 Diagnosis(诊断)、Differential Diagnosis(鉴别诊断)、Clinical Description(临床描述)、Management(管理)、Genetic Counseling(遗传咨询)、Molecular Genetics(分子遗传学)、Genetic Testing(基因检测)、Medical Genetics(医学遗传)。筛选主题详细指令请见：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/help/
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【检索实例】
1. Search for COVID-19 article
进入“Clinical Queries”后，假设想找 Remdesivir (瑞德西韦) 新冠肺炎治疗药的相关临床文献，步骤如下：(1) Filter category选择“COVID-19”，(2) Filter选择“Treatment”，以(3)关键字“Remdesivir” 进行查找。查找页面下方就是检索结果列表，可点击(4)“See all results in PubMed”，接著连回PubMed的检索画面。
进入PubMed的检索结果画面，从上方检索框可以看到，所下的检索策略为 (Remdesivir) AND LitCTREATMENT[filter] ， LitCTREATMENT就是Filter: Treament，其背后完整的检索指令请见此说明。
这些检索结果还可以利用PubMed左侧原有的Filters再次限缩，例如勾选AGE里的Child: 6-12 years，可以筛选出研究对象年龄限定与包含在6-12岁的相关文献。
2. Search for clinical study category
若要搜索临床研究的文献，则步骤如下：在“Clinical Queries”页面，(1) Filter category选择“Clinical Study”，(2) Filter选择“Etiology”，(3) Scope可选择“Narrow”或“Board”，此处使用“Narrow”。“Narrow”表示条件较严格，找到的文献量较少，但可较精准命中需求；“Broad”表示条件较松，找到的文献量较多，但可能会捞到一些不是非常切合的文献。详细请见其检索指令。(您可以根据查找结果的数量、相关性选择切换“Broad”或“Narrow”)
接著以(4)关键字“depressive disorders”查找，查找忧郁疾患病因学的相关临床文献。
一样可以点击进PubMed查找界面确认，并进一步使用PubMed原有的Filter再次筛选，例如勾选SEX里的Male，找出研究对象限定男性与包含男性的相关主题文献。
3. Medical genetics searches
医学遗传的临床医学文献查找其选项并未在“Clinical Queries”出现。但是，我们仍可以使用PubMed已设置好的筛选指令进行查找。查找步骤与指令如下：”关键字 AND 筛选主题名称[filter]”。例如要查镰刀型红细胞疾病基因咨询相关文献，可用”sickle cell anemia AND genetic counseling[filter]” 直接在PubMed查找。医学遗传下已设置好的筛选主题(filter)，前面内容有叙述，也可查阅此处。
接著介绍“Topic-Specific Queries”。实际上“Topic-Specific Queries”就是 PubMed 存放这些主题筛选指令的大本营，前面介绍的“Clinical Queries”就是“Topic-Specific Queries”中的第一项。所以，若您要用这些主题筛选指令，直接来“Topic-Specific Queries”页面就可以了。目前“Topic-Specific Queries”没有直接出现在 PubMed 网页里，属于National Library of Medicine下的一个目录，若要使用此功能可直接链接网址：https://www.nlm.nih.gov/psd/special_queries.html
“Topic-Specific Queries”的页面由上而下，分为两大区块：
1.“Clinicians Queries/ Health Services Researchers Queries”：“临床”和“健康服务”两大主题，其现成的检索策略最为完善周全。前面介绍的“Clinical Queries”就是此区块的第一项。
2. 第二区块是现在已不再更新的检索策略/指令，包含各项主题文献、期刊以及兽医学。
每个区块的呈现方式，左栏为“主题名称”，右栏则提供“检索策略/指令(View search strategy)”，若有需要可以点击进入拷贝这些指令贴到PubMed与所要查找的关键字结合查找
【将主题筛选指令与文献查找的过程结合：Filter】
经过以上的说明，您已经知道：
- 主题筛选指令：是 PubMed 预先设计好的一串完整指令，用户可以套用这些现成指令，在 PubMed 中筛选出条件相符的文献。
- 有哪些主题筛选指令：都罗列于“Topic-Specific Queries”网页中，包含“Clinical Queries”。“Topic-Specific Queries”页面中，左栏是“主题名称”，右栏是该主题的说明，稍微找一下就可以看到各主题的筛选指令详细内容。
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这些“Topic-Specific Queries”中的主题筛选指令，是用来筛选的。一般来说，您会先通过自然语言查找，或通过 MeSH ，下达您的主要关键词，若查到的文献太多、或分布范围太广太杂，才用这些主题筛选指令来筛选查找结果。因此，这些主题筛选指令最适合使用的地方，是作为“查找结果页面中的 Filter”。
有些“Topic-Specific Queries”中的主题筛选指令，原本就已经是默认的 Filters ，有些则需要进入个人化的“My NCBI Filters”功能中调用出来。接下来请参考“My NCBI Filters”一文，会详细说明如何将您需要的主题筛选指令加入 Filters 中。
作者：张育铭
本文更新历程：
Ying-Fang Huang 2020/8/7, 2022/5/27