从机构评鉴的角度而言，各机构发表文章被收录于 Web of Science 或 SCOPUS 的数量，已被运用于多种大学排名的评分依据之一。Web of Science 与 SCOPUS 均提供查找机构文献的功能，以下分别介绍：
【Web of Science】
详见“Web of Science 机构 / 学校查找功能介绍”。
除了 Web of Science 外，以查找顶尖文章、机构、期刊、学者著称的 Essential Science Indicators (简称 ESI ) 数据库，提供 WOS 的“SCIE”和“SSCI”中被引用次数最高的前1%机构，象征顶尖机构。详细请见“Essential Science Indicators(ESI)顶尖学术指针查找”一文。
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【SCOPUS】
详见“SCOPUS 机构 / 学校查找 (Affiliation Search) 功能介绍”以及“如何用Scopus“指令检索”查找台大某系所的文章数？(AFFIL v.s. AFFILORG)”。
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整体而言，SCOPUS 较 Web of Science 多提供了针对特定机构设立的专页，提供基本数据、文章清单、作者清单、来源清单、合作机构清单、以及各主题领域发表文章数等分析数据。不过在检索特定学院 / 系所的文章方面，SCOPUS 未如 Web of Science 提供“SAME”指令 (指定机构名称与学院 / 系所名称位于同一行)，查找结果可能较不精确。
在捞出了机构发表的文章后，若想做进一步的分析，可利用前面介绍的“(3)趋势与分析”达到。
By 张育铭
updated by 李明锦 (Ming-Ching Lee) 2022/6/1