自 X4 版推出的“PDF Import”功能，让用户可将既已收集的 PDF 全文档一次转入 EndNote，并有机会同时带入文献书目，大大降低了转换者的进入门槛。但原本的 PDF 档通常已根据用户自定义的主题作分类，转入 EndNote 后，需重新建立 Groups、并将文献逐篇归类，有点麻烦。现在 X7 中有了改良，让您在 PDF 导入的同时，能保留原有的文献分类与文件夹名称。
【导入时勾选 Create a Group Set for this import】
假设我原本就有多个 PDF 分类文件夹，希望导入 EndNote 后能保有原本的分类，可先建立一个上层文件夹（例：“Agriculture”），将其他文件夹归入其下：
几乎和一般的“PDF Import”相同，点击“File”→“Import”→“Folder”：
接下来依序选择：
- “Choose”：选择第一层主题文件夹（本例为“Agriculture”）。
- 勾选“Include files in subfolders”和“Create a Group Set for this import”。
- “Import Option”选择“PDF”。
- 点击“Import”。
导入完成后，会呈现以下状况：
- 第一层文件夹“Agriculture”成为 Group Set（母群）。
- 第二层文件夹分别建立为“Group”，隶属于“Agriculture”这个母群之下。
- 每个“Group”中存放原本的 PDF 文献，省去了逐篇手动分类的作业。
【美中不足：只能处理 2 层文件夹的架构】
假如原本的分类架构更多层，例如“Agriculture”（第一层）＞“Agricultural Economy”（第二层）＞“Agricultural Products Promotion”（第三层）。按前述的方法导入后，会怎么样呢？
很抱歉，EndNote 目前仅能处理两层文件夹的架构，第三层“Agricultural Products Promotion”中的 PDF 可以导入，但仅能被归类到第二层“Agricultural Economy”这个 Group 中，和“Agricultural Economy”中的 PDF 混在一起，无法独立显示出“Agricultural Products Promotion”这个 Group。
若您原本的文件夹结构超过两层，但希望原有的文件夹名称、PDF 分类都能转换到 EndNote，建议您，把第三层以下的文件夹全部先手动提升到第二层。以此例来说，必须把“Agricultural Products Promotion”往上拉到第二层，导入后才能直接将此文件夹建立为 Group、并保留里面的文献：
（您可能会觉得更大的不方便应该是 EndNote 只能容许 Group Set 和 Group 两个层次，无法达到更多主题层次的需求。希望未来能够改善！）