中国历史地名查询系统目前着重于建置从明至今台湾地区与中国各行政区划的演变资料，并搜罗文献所藏之舆图（如明清方志之疆域图、山川图、城池图等）。此系统是本所与计算中心、人社中心地理资讯科学研究专题中心等单位共同合作开发。
本查询系统主要提供地名、地图二种检索方式，让使用者能透过关键字迅速搜寻到各行政区划沿革与相关地图之资讯。此外，地图亦提供线上阅览功能（限中央研究院历史语言研究所傅斯年图书馆馆内使用），以利与地名资料相互参照。
参考文献主要来自下列数种：第一，正史、实录及相关史料。第二，地方志。第三，相关参考工具书、专书、地图集。第四，可靠度较高的网路资料，如各地方政府的官方网站。
未来，本系统意欲与本所已建构之明清档案内阁大库系统、明清人名权威资料库进行整合应用，例如上述二系统里的籍贯、履历等栏位，均可加上地名标记， 以与本系统相互连结参照，使人事地资讯结合，让使用者能迅速且清楚明了其关联性脉络，将有利于研究之统合。